O PPGCE/UERJ contempla atualmente duas áreas de concentração e cinco linhas de pesquisa:
Políticas Públicas
Políticas Econômicas
Economia Internacional
Economia Agrária
e do Meio Ambiente
Economia Quantitativa
Estudo em Equilíbrio Geral Aplicado
Prof. Octávio Augusto Fontes Tourinho.
Finanças Quantitativas e Análises de Risco
Prof. Fernando Aiube. Prof. Andrea Ugolini.
Núcleo de Estudos Pesquisas e Extensão em Direito da Cidade
Prof.ª Angela Moulin Simões Penalva Santos. Prof.ª Aricia Fernandes Correia (Faculdade de Direito/UERJ).)
Política Agrícola e Comércio Internacional
Prof. Léo da Rocha Ferreira.
Políticas Públicas e Território
Prof.ª Angela Moulin Simões Penalva Santos.
Regulação e Valoração Econômica Ambiental
Prof. Ronaldo Serôa da Motta
Sistema Financeiro, Macroeconomia Aberta e Mercosul
Prof. Luiz Fernando Rodrigues de Paula.